An der Universität Erfurt wurde die Hochschulreform, die Deutschland gemeinsam mit den anderen europäischen Ländern 1999 in Bologna beschlossen hat, erfolgreich umgesetzt: Die vormaligen Magister-, Diplom- und Staatsexamensstudiengänge wurden durch ein zweistufiges System von Studiengängen abgelöst:

Stufe 1: Studiengänge, die zum Bachelor (Baccalaureus) führen

Stufe 2: Studiengänge, die zum Master (Magister) führen

 mehr Informationen für Studierende zum Bologna-Prozess beim Bologna-Zentrum der Hochschulrektorenkonferenz

Darüber hinaus werden von der Universität Erfurt ein grundständiger Magister-Studiengang Katholische Theologie sowie weiterbildende Studiengänge angeboten.